La història gira al voltant de les habilitats especials que un petit percentatge de joves desenvolupen a la pubertat. Yuu Otosaka usa el seu poder per al seu benefici sense que ningú ho sàpiga i porta una vida bastant normal, una vida estudiantil comuna. Davant d'ell apareix un dia una noia anomenada Nau Tomori. A causa de la seva trobada amb Nau, el destí d'aquells amb poders especials quedarà a l'descobert. Aquesta és la història de com aquells amb poders especials experimenten la joventut, mentre aprenen a donar-li bon ús a les seves habilitats.